Bioinformatics and Genomics Retreat - Visionary talk

上周末参加了我们program学生主办的 Bioinformatics and Genomics Retreat，很欢乐。

首先登场的是 visionary talk，Ross 谈了基因治疗的利弊并展望了基因组研究对健康的帮助；Claude 讲了寄生植物对 food security 的影响。不过真正触发会场G点的是 Istvan 讲的：Bioinformatics skills of the present and future。

首先，Istvan 说生物信息学家如同建筑工人，科学家就如同建筑设计师，建筑工人拿着设计师设计的图纸来盖楼。人们看到盖好的楼，都会称赞设计师的天才与灵感，而不会记得建筑工人的名字，但是没有建筑工人就没有楼。那么建筑工人需要哪些技能呢？

SYS(tematic), ALGO(rithmatic), STAT(istic), BIO(logical), VERB(al) and LUCK!

按照我自己的理解，SYS是综合能力，就是综合运用各种其他技能解决问题的能力。比如从生物问题中抽象出模型，使用统计软件分析数据，联系背后的生物学意义，再进行阐述和讨论之类。

ALGO顾名思义，就是算法知识。其实算法未必一定是算法导论里讲到的才算，把大象关进冰箱的三部曲也算的。

STAT就是统计，经典统计检验和贝叶斯分析都应该知道，至少听说过R。

BIO的范围太广啦，请参阅各大高校生物专业培养方案。当然我觉得对于生物信息学最重要的是分子生物学以及各种测序技术。

VERB就是语言表达能力和交流能力。当你能向别人讲明白问题时，你才算真正明白了问题。

LUCK，按 Istvan 的话讲，是青睐于有准备滴人的。

下图是 Istvan 的 skill bar：

Istvan 说，每个人都可以画这么一张图，他的建议是，增强你最强的技能，这样你就不可替代了，同时也要弥补过于弱的技能。

然后讲到振奋人心的一点，就是不同于其他的科学，生物信息学是最容易重复前人研究结果的。你不需要复杂的仪器，也不需要剧毒的试剂，只需要一台计算机（啊我真是个诗人- - ）。但是现实不是完美的，Istvan 痛斥了生物信息学领域的学术论文的方法部分和实际情况的差异：

这就是为什么你按照一篇论文的方法怎么也重复不出来它的结果。

visionary talk 结束之后就是 panel discussion，就是刚才的3位演讲者同时登台回答问题。头一次见到这种场面，还是很欢乐的。

说到生物信息学的标准问题。现在有无数种 chip-seq 的 peak calling 方法，不同方法得出的结果也不尽相同。因此需要 “Industrialized” bioinformatics。但是我们专业的同学们就担心起来，如果以后生物信息学成为了生物学研究的必备知识，我们失业了怎么办？

第一天的演讲就在欢乐祥和的气氛中结束了，大家纷纷挥舞着刀叉向晚饭杀去。