用R和BioConductor进行基因芯片数据分析(一)：R和BioConductor简介

R是开源的统计计算和作图语言，与S语言很相似。R的语法与其他语言很相似，功能很强大，可以到这里看看截图。主页是 http://www.r-project.org/ 可以点击这里下载最新版R-2.7.0，这里有很权威的英文教程。本站提供几本中文教程(pdf)的打包下载，更多的随便搜索一下就可以找到。

BioConductor是建立在R语言环境上的生物芯片数据和基因组数据分析软件包，主页是 http://www.bioconductor.org/ BioConductor由许多package组成，可以全部安装，也可以单独安装。BioConductor的安装是在R控制台，输入： source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”) biocLite() 更多安装设置请看这里 如果只想单独安装其中某些package，可以在http://bioconductor.fhcrc.org/packages/1.9/bioc/ 看到最新版BioConductor中所有package的列表。 BioConductor的使用文档可以在这里找到，而这里给出了其中package的简单使用方法。