Case Study: 用R和BioConductor进行基因芯片数据分析

这学期的BioinformaticsII课程project是用R和BioConductor进行基因芯片数据分析。于是决定边做边写个实例教程。本帖就作为目录帖，放入这一系列文章的链接。 用R和BioConductor进行基因芯片数据分析(一)：R和BioConductor简介 用R和BioConductor进行基因芯片数据分析(二)：缺失值填充 用R和BioConductor进行基因芯片数据分析(三)：计算median 用R和BioConductor进行基因芯片数据分析(四)：芯片内归一化 用R和BioConductor进行基因芯片数据分析(五)：芯片间归一化 用R和BioConductor进行基因芯片数据分析(六)：差异表达基因

恩，全部贴完啦，以上就是我们的term project简化版。如果想了解更多用R进行的基因芯片数据分析，比如主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)，聚类分析(clustering）以及监督分析(Supervised Analyses)，请参考我们的课程主页：http://www.stat.psu.edu/~chiaro/BioinfoII_08/